MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 plasmid CMR15_mp

Total Repeats: 45857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017589	CAT	2	6	807	812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683948
2	NC_017589	GACT	2	8	824	831	25 %	25 %	25 %	25 %	410683948
3	NC_017589	CAT	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683948
4	NC_017589	G	6	6	882	887	0 %	0 %	100 %	0 %	410683948
5	NC_017589	CGA	2	6	927	932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683948
6	NC_017589	CG	3	6	1021	1026	0 %	0 %	50 %	50 %	410683948
7	NC_017589	CGC	2	6	1037	1042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683948
8	NC_017589	TGA	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683948
9	NC_017589	CAG	2	6	1102	1107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683948
10	NC_017589	GAA	3	9	1227	1235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683948
11	NC_017589	GCG	2	6	1238	1243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683948
12	NC_017589	CCG	2	6	1266	1271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683948
13	NC_017589	GGC	2	6	1333	1338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683948
14	NC_017589	CAG	2	6	1366	1371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683948
15	NC_017589	CCA	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683948
16	NC_017589	CAA	2	6	1425	1430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683948
17	NC_017589	ATCG	3	12	1449	1460	25 %	25 %	25 %	25 %	410683948
18	NC_017589	TGG	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683948
19	NC_017589	GTG	2	6	1543	1548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683948
20	NC_017589	T	6	6	1561	1566	0 %	100 %	0 %	0 %	410683948
21	NC_017589	GC	4	8	1602	1609	0 %	0 %	50 %	50 %	410683948
22	NC_017589	CTT	2	6	1668	1673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683948
23	NC_017589	TGG	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683948
24	NC_017589	CACG	2	8	1853	1860	25 %	0 %	25 %	50 %	410683948
25	NC_017589	C	7	7	2406	2412	0 %	0 %	0 %	100 %	410683949
26	NC_017589	GCA	3	9	2414	2422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683949
27	NC_017589	GACCA	2	10	2481	2490	40 %	0 %	20 %	40 %	410683949
28	NC_017589	GC	3	6	2542	2547	0 %	0 %	50 %	50 %	410683949
29	NC_017589	CCG	2	6	2891	2896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683950
30	NC_017589	TGA	2	6	2904	2909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683950
31	NC_017589	GAC	2	6	3413	3418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683951
32	NC_017589	GCAT	2	8	3424	3431	25 %	25 %	25 %	25 %	410683951
33	NC_017589	GCA	2	6	3457	3462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683951
34	NC_017589	TCG	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683951
35	NC_017589	GGC	2	6	3509	3514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683951
36	NC_017589	GACTAC	2	12	3609	3620	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410683951
37	NC_017589	GTG	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683951
38	NC_017589	CAT	2	6	3692	3697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683951
39	NC_017589	CGC	2	6	3712	3717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683951
40	NC_017589	GCG	2	6	3729	3734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683951
41	NC_017589	GCA	2	6	3755	3760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683951
42	NC_017589	TGA	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683951
43	NC_017589	CAT	2	6	3983	3988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683951
44	NC_017589	GTT	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683951
45	NC_017589	GGCA	2	8	4021	4028	25 %	0 %	50 %	25 %	410683951
46	NC_017589	CGC	2	6	4075	4080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683952
47	NC_017589	GCCC	3	12	4165	4176	0 %	0 %	25 %	75 %	410683952
48	NC_017589	GCG	2	6	4216	4221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683952
49	NC_017589	GTC	2	6	4223	4228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683952
50	NC_017589	CAG	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683952
51	NC_017589	CAG	2	6	4331	4336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683952
52	NC_017589	GC	3	6	4408	4413	0 %	0 %	50 %	50 %	410683952
53	NC_017589	TGC	3	9	4417	4425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683952
54	NC_017589	AGC	2	6	4506	4511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683952
55	NC_017589	CTT	2	6	4556	4561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683952
56	NC_017589	GAT	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683952
57	NC_017589	A	7	7	4576	4582	100 %	0 %	0 %	0 %	410683952
58	NC_017589	GAA	2	6	4583	4588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683952
59	NC_017589	CAA	2	6	4627	4632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683952
60	NC_017589	TGA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683952
61	NC_017589	GGA	2	6	4783	4788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683952
62	NC_017589	GCC	2	6	4866	4871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683952
63	NC_017589	CTG	2	6	4901	4906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683952
64	NC_017589	GAC	2	6	4958	4963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683952
65	NC_017589	GGC	2	6	4966	4971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683952
66	NC_017589	TGG	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683952
67	NC_017589	AGCC	2	8	5031	5038	25 %	0 %	25 %	50 %	410683952
68	NC_017589	GC	3	6	5349	5354	0 %	0 %	50 %	50 %	410683953
69	NC_017589	CCAT	2	8	5401	5408	25 %	25 %	0 %	50 %	410683953
70	NC_017589	CGC	2	6	5502	5507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683953
71	NC_017589	CTGG	2	8	5516	5523	0 %	25 %	50 %	25 %	410683953
72	NC_017589	GCC	2	6	5539	5544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683953
73	NC_017589	G	6	6	5593	5598	0 %	0 %	100 %	0 %	410683953
74	NC_017589	CCCG	3	12	5685	5696	0 %	0 %	25 %	75 %	410683953
75	NC_017589	CG	3	6	5698	5703	0 %	0 %	50 %	50 %	410683953
76	NC_017589	ATCGGT	2	12	5724	5735	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410683953
77	NC_017589	ATGG	2	8	5756	5763	25 %	25 %	50 %	0 %	410683953
78	NC_017589	CG	3	6	5793	5798	0 %	0 %	50 %	50 %	410683953
79	NC_017589	GC	3	6	5814	5819	0 %	0 %	50 %	50 %	410683953
80	NC_017589	GGC	2	6	5834	5839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683953
81	NC_017589	ACG	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683953
82	NC_017589	CAG	2	6	6027	6032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683953
83	NC_017589	G	6	6	6136	6141	0 %	0 %	100 %	0 %	410683953
84	NC_017589	GGGT	2	8	6156	6163	0 %	25 %	75 %	0 %	410683953
85	NC_017589	CGT	3	9	6169	6177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683953
86	NC_017589	AGCC	2	8	6511	6518	25 %	0 %	25 %	50 %	410683954
87	NC_017589	GAAA	2	8	6520	6527	75 %	0 %	25 %	0 %	410683954
88	NC_017589	TGC	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683954
89	NC_017589	GGA	2	6	6568	6573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683954
90	NC_017589	GCA	2	6	6581	6586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683954
91	NC_017589	GAT	2	6	6598	6603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683954
92	NC_017589	GAA	2	6	6682	6687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683954
93	NC_017589	GTCCA	2	10	6710	6719	20 %	20 %	20 %	40 %	410683954
94	NC_017589	GCCG	2	8	6724	6731	0 %	0 %	50 %	50 %	410683954
95	NC_017589	CTGGGC	2	12	6767	6778	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	410683954
96	NC_017589	TGTGT	2	10	6784	6793	0 %	60 %	40 %	0 %	410683954
97	NC_017589	CGA	2	6	6811	6816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683954
98	NC_017589	CTG	2	6	6845	6850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683954
99	NC_017589	GCC	2	6	6859	6864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683954
100	NC_017589	GCA	2	6	6871	6876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683954
101	NC_017589	TCG	2	6	6912	6917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683954
102	NC_017589	CGC	2	6	6933	6938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683954
103	NC_017589	GTG	2	6	6959	6964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683954
104	NC_017589	TCG	2	6	7008	7013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683954
105	NC_017589	GGA	2	6	7027	7032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683954
106	NC_017589	CGC	2	6	7074	7079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683954
107	NC_017589	GCGG	2	8	7115	7122	0 %	0 %	75 %	25 %	410683954
108	NC_017589	GACG	2	8	7135	7142	25 %	0 %	50 %	25 %	410683954
109	NC_017589	GAG	2	6	7163	7168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683954
110	NC_017589	GCA	2	6	7212	7217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683954
111	NC_017589	AAG	2	6	7370	7375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683954
112	NC_017589	TGC	2	6	7377	7382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683954
113	NC_017589	ACG	2	6	7720	7725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683955
114	NC_017589	TCT	2	6	7771	7776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683955
115	NC_017589	GTCG	2	8	7781	7788	0 %	25 %	50 %	25 %	410683955
116	NC_017589	TCG	2	6	7795	7800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683955
117	NC_017589	CTT	2	6	7853	7858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683955
118	NC_017589	CGG	3	9	7894	7902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683955
119	NC_017589	GGCT	2	8	7938	7945	0 %	25 %	50 %	25 %	410683955
120	NC_017589	GC	4	8	7979	7986	0 %	0 %	50 %	50 %	410683955
121	NC_017589	GTCG	2	8	7994	8001	0 %	25 %	50 %	25 %	410683955
122	NC_017589	CCA	2	6	8050	8055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683955
123	NC_017589	GCT	2	6	8075	8080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683955
124	NC_017589	CTG	2	6	8094	8099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683955
125	NC_017589	GTCG	2	8	8108	8115	0 %	25 %	50 %	25 %	410683955
126	NC_017589	GCG	2	6	8116	8121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683955
127	NC_017589	GCT	2	6	8234	8239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683955
128	NC_017589	TGC	2	6	8245	8250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683955
129	NC_017589	TTC	2	6	8304	8309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683955
130	NC_017589	GC	3	6	8323	8328	0 %	0 %	50 %	50 %	410683955
131	NC_017589	GGA	2	6	8357	8362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683955
132	NC_017589	GAA	2	6	8396	8401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683955
133	NC_017589	CG	3	6	8434	8439	0 %	0 %	50 %	50 %	410683955
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259	NC_017589	GCG	2	6	12427	12432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683958
260	NC_017589	GCA	2	6	12452	12457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683958
261	NC_017589	CAG	2	6	12471	12476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683958
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263	NC_017589	ACC	2	6	12508	12513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683958
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390	NC_017589	AAG	2	6	17451	17456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683961
391	NC_017589	GAA	2	6	17465	17470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683961
392	NC_017589	ACG	3	9	17491	17499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683961
393	NC_017589	AAG	2	6	17529	17534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683961
394	NC_017589	GC	3	6	17691	17696	0 %	0 %	50 %	50 %	410683961
395	NC_017589	CAT	2	6	17717	17722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683961
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397	NC_017589	TGGG	2	8	17787	17794	0 %	25 %	75 %	0 %	410683961
398	NC_017589	TCGA	2	8	17805	17812	25 %	25 %	25 %	25 %	410683961
399	NC_017589	TCA	2	6	17839	17844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683961
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402	NC_017589	GC	3	6	18045	18050	0 %	0 %	50 %	50 %	410683961
403	NC_017589	GCCG	2	8	18056	18063	0 %	0 %	50 %	50 %	410683961
404	NC_017589	ACG	2	6	18067	18072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683961
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410	NC_017589	GCG	2	6	18438	18443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683962
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423	NC_017589	GC	3	6	18736	18741	0 %	0 %	50 %	50 %	410683962
424	NC_017589	GGC	3	9	18760	18768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683962
425	NC_017589	GCT	2	6	18769	18774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683962
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496	NC_017589	GCG	2	6	21253	21258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683965
497	NC_017589	AGC	2	6	21259	21264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683965
498	NC_017589	CG	3	6	21282	21287	0 %	0 %	50 %	50 %	410683965
499	NC_017589	CG	3	6	21301	21306	0 %	0 %	50 %	50 %	410683965
500	NC_017589	TGC	3	9	21307	21315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683965

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